Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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RABEP1Q15276 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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