Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms