Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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