Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 DMPK-206ENST00000588522 2920 ntTSL 517.45■□□□□ 0.384e-6■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.371e-12■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.046e-7■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.87e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 AHCY-204ENST00000480653 2211 ntTSL 216.49■□□□□ 0.237e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.027e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.48e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.48e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 ANKRD13A-210ENST00000553251 3315 ntTSL 28.88□□□□□ -0.993e-7■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 MRPS35-203ENST00000538315 1715 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.298e-42■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 MRPS35-201ENST00000081029 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.428e-42■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 ARL2-203ENST00000529254 601 nt17.06■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 HDLBP-245ENST00000494862 356 ntTSL 212.83□□□□□ -0.361e-7■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.359e-8■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.329e-8■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 RPL13-211ENST00000563270 554 ntTSL 417.56■□□□□ 0.41e-46■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt15.27■□□□□ 0.033e-17■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 214.1□□□□□ -0.153e-17■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 213.65□□□□□ -0.223e-17■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 MECR-210ENST00000475773 780 ntTSL 322.89■■□□□ 1.254e-9■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 MECR-214ENST00000483435 571 ntTSL 221.59■■□□□ 1.054e-9■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 MECR-208ENST00000473030 919 ntTSL 319.76■□□□□ 0.754e-9■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.524e-9■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.344e-9■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 ANXA5-211ENST00000515717 594 ntTSL 29.72□□□□□ -0.854e-9■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.825e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.65e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.355e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.242e-19■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.15e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.832e-19■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 PYGB-203ENST00000471359 726 ntTSL 216.36■□□□□ 0.212e-19■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.022e-19■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-19■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-19■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-7■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.355e-7■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 RPS26-203ENST00000552361 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.415e-7■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.476e-11■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 ACSM3-207ENST00000562251 1931 ntTSL 28.1□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 ACSM3-212ENST00000567711 438 ntTSL 36.1□□□□□ -1.432e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 ACSM3-210ENST00000567006 520 ntTSL 26.09□□□□□ -1.432e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.662e-6■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 CIZ1-220ENST00000485862 843 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-26■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 CIZ1-210ENST00000461765 677 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-26■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.516e-12■■■■□ 24.2
PABPC4Q13310 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.443e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.233e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.633e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.43e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 METTL26-209ENST00000565163 485 ntTSL 323.08■■□□□ 1.295e-10■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 METTL26-208ENST00000564039 518 ntTSL 220.69■□□□□ 0.97e-10■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-201ENST00000262146 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-209ENST00000521247 798 ntTSL 46.29□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-207ENST00000518800 2393 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-211ENST00000523158 542 ntTSL 35.93□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-205ENST00000518352 574 ntTSL 35.84□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-214ENST00000527155 679 ntTSL 32.36□□□□□ -2.032e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MTFR1-208ENST00000520398 417 ntTSL 22.15□□□□□ -2.072e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 SPCS1-204ENST00000474945 981 ntTSL 216.43■□□□□ 0.223e-11■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 GTF3A-202ENST00000419181 1191 ntTSL 1 (best)24.37■■□□□ 1.493e-8■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.273e-8■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 GTF3A-206ENST00000470606 1919 ntTSL 29.33□□□□□ -0.923e-8■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 GTF3A-207ENST00000482655 829 ntTSL 25.34□□□□□ -1.553e-8■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TNKS1BP1-202ENST00000427750 1946 ntTSL 222.86■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 517.2■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TNKS1BP1-206ENST00000532273 592 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 HBS1L-204ENST00000367826 2703 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.673e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.913e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.23e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 HBS1L-210ENST00000527005 2224 ntTSL 1 (best)4.54□□□□□ -1.683e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.758e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.098e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.842e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TTLL12-203ENST00000484711 2451 ntTSL 216.78■□□□□ 0.282e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.44e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.794e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.764e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.724e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 325.67■■□□□ 1.74e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 524.38■■□□□ 1.494e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.454e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)23.73■■□□□ 1.394e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.394e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 423.59■■□□□ 1.374e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 RRM2B-208ENST00000522368 1613 ntTSL 222.52■■□□□ 1.24e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.14e-7■■■■□ 24.1
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