Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALCOCO2Q13137 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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