Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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