Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms