Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms