Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms