Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC5P78333 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
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GPC5P78333 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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