Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFRD-1P60508 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms