Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BACE1P56817 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BACE1P56817 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BACE1P56817 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BACE1P56817 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BACE1P56817 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BACE1P56817 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms