Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL23P55773 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL23P55773 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL23P55773 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL23P55773 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL23P55773 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL23P55773 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms