Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACLYP53396 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACLYP53396 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACLYP53396 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACLYP53396 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACLYP53396 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACLYP53396 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACLYP53396 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms