Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV1P50549 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ETV1P50549 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ETV1P50549 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms