Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRP9P49458 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRP9P49458 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms