Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms