Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNB1P35222 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms