Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD27P26842 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD27P26842 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD27P26842 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD27P26842 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD27P26842 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD27P26842 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms