Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms