Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DESP17661 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DESP17661 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DESP17661 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DESP17661 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DESP17661 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DESP17661 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DESP17661 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DESP17661 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DESP17661 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms