Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms