Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALAP11233 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALAP11233 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALAP11233 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RALAP11233 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RALAP11233 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RALAP11233 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RALAP11233 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RALAP11233 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RALAP11233 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RALAP11233 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RALAP11233 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RALAP11233 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RALAP11233 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms