Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms