Protein–RNA interactions for Protein: P0C7X2

ZNF688, Zinc finger protein 688, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF688P0C7X2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF688P0C7X2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms