Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP1P09874 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP1P09874 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP1P09874 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP1P09874 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP1P09874 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP1P09874 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP1P09874 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP1P09874 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP1P09874 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP1P09874 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP1P09874 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms