Protein–RNA interactions for Protein: P08590

MYL3, Myosin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL3P08590 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL3P08590 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL3P08590 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL3P08590 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL3P08590 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL3P08590 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL3P08590 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL3P08590 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL3P08590 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL3P08590 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL3P08590 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL3P08590 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms