Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDN1P05305 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDN1P05305 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDN1P05305 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDN1P05305 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDN1P05305 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms