Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC3P02656 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC3P02656 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms