Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTAP01374 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTAP01374 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LTAP01374 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTAP01374 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTAP01374 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTAP01374 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTAP01374 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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