Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS1O15524 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms