Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRBV20-1A0A075B6N2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRBV20-1A0A075B6N2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRBV20-1A0A075B6N2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV20-1A0A075B6N2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRBV20-1A0A075B6N2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TRBV20-1A0A075B6N2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TRBV20-1A0A075B6N2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TRBV20-1A0A075B6N2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV20-1A0A075B6N2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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