Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00312Q9Y6C7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00312Q9Y6C7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00312Q9Y6C7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00312Q9Y6C7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00312Q9Y6C7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00312Q9Y6C7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00312Q9Y6C7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00312Q9Y6C7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00312Q9Y6C7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00312Q9Y6C7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms