Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSAG2Q9Y5P2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSAG2Q9Y5P2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSAG2Q9Y5P2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSAG2Q9Y5P2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSAG2Q9Y5P2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSAG2Q9Y5P2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms