Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Y9

LSM5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM5Q9Y4Y9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM5Q9Y4Y9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM5Q9Y4Y9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM5Q9Y4Y9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM5Q9Y4Y9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM5Q9Y4Y9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms