Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFAF1Q9Y375 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFAF1Q9Y375 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFAF1Q9Y375 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFAF1Q9Y375 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NDUFAF1Q9Y375 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFAF1Q9Y375 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFAF1Q9Y375 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFAF1Q9Y375 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms