Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ICE1Q9Y2F5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ICE1Q9Y2F5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ICE1Q9Y2F5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ICE1Q9Y2F5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ICE1Q9Y2F5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ICE1Q9Y2F5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ICE1Q9Y2F5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ICE1Q9Y2F5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms