Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIPT1Q9Y234 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPT1Q9Y234 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIPT1Q9Y234 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPT1Q9Y234 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIPT1Q9Y234 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms