Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMP3Q9UQV4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMP3Q9UQV4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMP3Q9UQV4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP3Q9UQV4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms