Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLCA2Q9UQC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA2Q9UQC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCA2Q9UQC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCA2Q9UQC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA2Q9UQC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms