Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MAPRE3Q9UPY8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAPRE3Q9UPY8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAPRE3Q9UPY8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAPRE3Q9UPY8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAPRE3Q9UPY8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms