Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A2Q9UPR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC8A2Q9UPR5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A2Q9UPR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms