Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PDZRN3Q9UPQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDZRN3Q9UPQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDZRN3Q9UPQ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDZRN3Q9UPQ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms