Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PACSIN2Q9UNF0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PACSIN2Q9UNF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PACSIN2Q9UNF0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PACSIN2Q9UNF0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACSIN2Q9UNF0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACSIN2Q9UNF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACSIN2Q9UNF0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms