Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCML1Q9UN30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCML1Q9UN30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCML1Q9UN30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCML1Q9UN30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms