Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AMFRQ9UKV5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMFRQ9UKV5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AMFRQ9UKV5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AMFRQ9UKV5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AMFRQ9UKV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AMFRQ9UKV5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AMFRQ9UKV5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms