Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMS3Q9UJD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMS3Q9UJD0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIMS3Q9UJD0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIMS3Q9UJD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms