Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM8Q9UJA3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM8Q9UJA3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM8Q9UJA3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM8Q9UJA3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM8Q9UJA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms