Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLXNA1Q9UIW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA1Q9UIW2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLXNA1Q9UIW2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PLXNA1Q9UIW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNA1Q9UIW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
PLXNA1Q9UIW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms