Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUF60Q9UHX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUF60Q9UHX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PUF60Q9UHX1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUF60Q9UHX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PUF60Q9UHX1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms